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生物資訊核心

 

生物資訊核心

 

介紹:

為支持本校及三家附屬醫院之跨領域生醫研究,研發處整合了校內生物資訊分析團隊,成立生物資訊核心設施,提供客製化服務(Customized Service),服務內容包含基因體研究、轉錄體學研究、蛋白質體學研究、系統生物學研究等分析。我們將針對您的需求規劃適合的分析步驟,包含研究設計、實驗平台建議、資料分析與篩選、實驗驗證、與enrichment analysis 等,並提供您相關軟體、分析工具與資料庫解說之專業諮詢,以利您進行各種功能性研究或轉譯醫學之應用研究。

 

諮詢教授:

本核心設施目前包括2位指導委員及7位服務教師團隊。

 

服務:

本核心設施設有服務窗口為您解說服務項目,並協助您與我們的服務教師進行需求訪談,為您找到適合的解決方案,我們建議您可從研究設計一開始就與我們聯絡,我們將竭誠為您服務。

 

基因體學(genomics)分析    

服務項目:  

1. SNP analysis and profiling

2. Genome-wide association study (GWAS)

3. De-novo genome annotation

4. Epigenetics analysis

5. Metagenomics analysis

6. Pharmacogenomics analysis

 

 

轉錄體學(transcriptomics)分析  

服務項目:  

1. mRNA/small RNA/micro RNA differential expression

2. mRNA alternative splicing
3. mRNA coding SNP profiling
4. De-novo RNA sequencing analysis

5. Gene set enrichment analysis (GSEA)

 

 

蛋白質體學(proteomics)分析  

服務項目:  

1. Protein structure and post-translational modification

2. De-novo protein sequencing analysis

3. Protein-DNA/RNA/protein interaction

4. Metabolomics analysis
 

 

 

系統生物學(systems biology)分析 

服務項目:

1. Pathway reconstruction (from experimental data)
2. Pathway network analysis

3. Pathway pertu407_75884070.pngrbation analysis (under SNPs/drugs/ environmental factors)

 

 

指導委員 (依姓名筆劃排列)

李友專 醫學資訊研究所 教授

徐建業 醫學資訊研究所 教授

劉建財 醫學資訊研究所 教授

 

服務教師團隊 (依職級與姓名筆劃排列)

 

張資昊 醫學資訊研究所 副教授 (兼任core manager)

•研究領域:Regulatory RNAs, Protein post-translational modifications, Epigenetics, Metagenomics

專長:

Integrative analysis for microarray and next-generation sequencing data in various biological applications

Cooperation in Interdisciplinary biological research

Identification of novel biomarkers for diagnosis and prognosis

Development of biological tools and databases

 
李元綺 醫學資訊研究所 副教授

研究領域:癌症基因體學、癌症轉移機轉研究、神經疾病基因體學

專長:

- Microarray data analysis

- Next Generation Sequencing data analysis

- Gene enrichment functional annotation

 

張偉嶠 臨床藥物基因體學暨蛋白質體學碩士學位學程 教授

研究領域:藥物基因體學、疾病基因關聯性研究、細胞鈣離子訊息影像分析

專長:

- Discovery for rare variants, SNP, somatic mutations (by exome sequencing)

- Functional analysis for disease/drug and genomics association

- Detection of real-time single cell calcium mobilization

 

王紋璋 轉譯醫學博士學位學程 副教授

研究領域:Genetic epidemiology, Genetic statistics

專長:

- Genetic linkage analysis

- Genetic association analysis

- High-throughput genomic data analysis

- False discovery rate (FDR) analysis

- Biostatistics

  

黃翠琴 癌症生物學與藥物研發博士學位學程 助理教授

•研究領域:利用系統生物學方法探討癌化過程及抗癌藥物作用機制

•專長:

- 系統生物學

- 蛋白質體學

- 癌症生物學

- 訊息傳遞分析

 

蘇家玉 醫學資訊研究所 副教授

•研究領域:計算生物學、蛋白質體學、蛋白質功能和結構預測分析、資料探勘

•專長:

- Computational biology

- Proteomics

- Protein structure and function prediction analysis

- Data mining

 

聯絡方式

emailcore manager專用信箱: bioinfo@tmu.edu.tw,將有專人盡速回覆